De rendabiliteit van het UV-systeem wordt bepaald door de volgende factoren: kosten van apparatuur en levensduur; elektrisch rendement; mate van vermindering van het sterilisatie-effect tijdens bedrijf; elektriciteitskosten, enz. De economische analyse van het ultraviolette desinfectiesysteem is nog niet afgerond. Er zijn veel analyserapporten met verschillende conclusies. Er zijn meningen dat het ultraviolette desinfectieapparaat veel elektriciteit verbruikt en dat het onderhoud en de kosten van de apparatuur hoog zijn. Voor grote systemen is de investering in apparatuur hoger dan die van het ozonsysteem en zijn de bedrijfskosten vergelijkbaar met die van ozon; maar voor het kleine systeem van zuiver waterproductie is de investering lager dan die van het ozonapparaat. Er zijn ook meningen dat voor behandelingsweegschalen van duizenden tonnen / dag of meer, de investerings- en bedrijfskosten van het UV-desinfectiesysteem zeer voordelig zijn, die veel lager zijn dan de kosten van chlorering en ozondesinfectie. Er zijn bijvoorbeeld rapporten met analytische gegevens dat bij het bouwen van een kleine drinkwaterzuiveringsinstallatie met een bevolking van 10 tot 25.000 inwoners de verhouding tussen ultraviolet, chloordioxide en ozon desinfectiekosten ongeveer 1: 4: (8-9) bedraagt, voor een bevolking groter dan Voor 500.000 maatschappelijke organisaties is de kostenratio ongeveer 1: 2,5: 2,5.
Deze kostenramingen omvatten niet de extra kosten voor het verwijderen van desinfectiebijproducten en cryptosporidiumcysten bij gebruik van niet-UV-desinfectieprocessen. Bovendien tonen analysegegevens aan dat de investerings- en bedrijfskosten van ultraviolette desinfectie lager zijn dan die van chloordesinfectie, en dat de desinfectiekosten ongeveer de helft zijn van die van chloor, maar het verschil wordt kleiner met de uitbreiding van de waterbehandelingsschaal.
In Frankrijk en de voormalige Sovjet-Unie was desinfectie met ultraviolet licht beperkt tot kleine apparatuur. De grote apparatuur die werd opgezet, was om ultraviolette lampen in serie te installeren in de leidingen van gefilterd water. In de Verenigde Staten is ultraviolette desinfectie ook beperkt tot kleine apparatuur en zwembaden, en wordt vaak gecombineerd met andere desinfecterende middelen. In praktische toepassingen is echter gemeld dat de schaal van drinkwaterplanten die gebruikmaken van ultraviolette desinfectie meer dan 1,5 miljoen ton per dag bedraagt.